Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms