Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNIKQ9UKE5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms