Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms