Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms