Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DKK2Q9UBU2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms