Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms