Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms