Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms