Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP1Q9NZU7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms