Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms