Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms