Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COMMD8Q9NX08 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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