Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms