Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms