Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC87Q9NVE4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC87Q9NVE4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms