Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms