Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms