Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms