Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO8Q9NRD0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms