Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7BQ9NP56 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms