Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms