Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms