Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms