Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTIF3Q9H2K0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms