Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms