Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP44Q9H0E7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms