Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN2Q9GZV7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms