Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms