Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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