Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN6Q9BZV1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN6Q9BZV1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms