Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms