Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms