Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNPPD1Q9BV87 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNPPD1Q9BV87 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms