Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YIPF4Q9BSR8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms