Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms