Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX2Q99697 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms