Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms