Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP19Q99542 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms