Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms