Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms