Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A9Q96Q91 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms