Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OPALINQ96PE5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms