Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD6Q96NK8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms