Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JSRP1Q96MG2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms