Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms