Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms