Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms