Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EME1Q96AY2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms