Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms