Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms